Запарился менять нумерацию в заголовках главы. Судя по всему она оказалась зашита в шаблон (не только тип нумерации, но иначальное значение. Вообще с шаблонами либо надо досконально разбираться, либо вовсе не связываться.

Надо было заголовки:

1.4 Второй уровень (название главы)

1.4.1 Третий уровень (раздел)

1.4.2 Ещё третий

Переименовать так чтобы номер главы стал 1.2

1.2 Второй уровень (название главы)

1.2.1 Третий уровень (раздел)

1.2.2 Ещё третий

По правой кнопке войти в нумерацию и переставить для второго уровня начальное значение в 2 получается - всё отлично перенумеровывается, включая рисунки и таблицы, но после сохранения и повторного открытия снова вылетает 1.4. Если там же где-то найти продолжение нумерации (с 2-я начальными значениями- на каждый уровень), и попробовать там переставить то пишет ошибку "Это значение меньше предыдущего элемента списка."

В общем как я понял - начальный номер установлен в шаблоне и каждый раз при открытии он считывает стили и в соответствии с ними обновляет. Решение такое нашёл (почти случайно):

Разработчик - >Шаблон Документа ->Автоматически обновлять стили (галку снять, т.е. не обновлять) (см. рис.)
Ну а потом уже менять нумерацию и сохраняться.