Нынешнее значение: Легко перелетать с места на место (о птице, бабочке и т. п.). (Словарь русского языка в 4-х томах. Т. 3. — 1999)
Прежнее значение: летать с трудом, плохо, или подлетывать, перелетывать, летать недалеко, взлетывая вскоре падать или садиться; | летать вблизи туда и сюда, с места на место. Молодые тетерева нелетны еще, едва порхают. (Даль)
Возможно происхождение от "порох" в значении "пыль": "поднимать пыль в результате неловких приземлений после коротких перелетов".