Родился будущий живописец в семье аристократа, лишенного владений и дворянских прав за участие в Польском восстании 1863 года.
К началу XX века Жуковский стал одним из самых известных в России пейзажистов импрессионистического направления. С 1903 года — член Товарищества передвижных художественных выставок; с 1907 г. — член Союза русских художников. Участвовал в выставках «Мира искусства». Жил преимущественно в Москве. Организовал здесь частную школу, где преподавал в 1907—1917.
Много путешествовал по Средней России, изучая старинные «дворянские гнезда».
В 1917 году художник уехал в Польшу. Там в 1920 году открыл частную школу живописи.
В 1930 годах И. И. Бродский и другие друзья художника уговаривали Жуковского вернуться в СССР, но он оставался в Польше.
Во время Второй мировой войны художник был арестован нацистами. Умер в концентрационном лагере в Прушкове в 1944 году.
