Обзор инструментов для визуального сравнения папок и файлов и разрешения конфликтов слияния:
http://habrahabr.ru/post/150001/
-----------------------------------------------------------------------------------
WinMerge является Open Source инструментом сравнения и слияния для Windows. WinMerge может сравнивать как файлы, так и папки, отображая различия в визуальной текстовой форме, которые легко понять и обработать: http://winmerge.org/
WinMerge 2.14.0
-----------------------------------------------------------------------------------
WinMerge — свободное ПО с открытым исходным кодом для сравнения и синхронизации файлов и директорий, распространяемое на условиях лицензии GNU GPL для Microsoft Windows.
Основные возможности: https://ru.wikipedia.org/wiki/Winmerge
+
http://www.hardforum.ru/t81274-2/
-----------------------------------------------------------------------------------