Если сотрудник организации обратился с заявлением о предоставлении стандартного налогового вычета и приложил документы, подтверждающие право на данный вычет, то у организации нет оснований для отказа в предоставлении вычета. На это обращает внимание УФНС России по г. Москве в письме от 21.08.2009 № 20-14/3/087475@. Если же течение налогового периода стандартные налоговые вычеты налогоплательщику не предоставлялись или были представлены в меньшем размере, то по окончании налогового периода налоговая инспекция должна пересчитать налоговую базу по НДФЛ с учетом предоставления стандартных налоговых вычетов в размерах, установленных статьей 218 НК РФ. Такой перерасчет производится на основании заявления налогоплательщика, прилагаемого к налоговой декларации, и документов, подтверждающих право на такие вычеты.