Первая эмблема Сибири в виде стрелы известны с 1555 года . Именно тогда к царскому титулу прибавилось «всея Сибирские земли и северные страны повелитель», а на государственной печати ИВАНА ГРОЗНОГО появился новый знак – стрела.

        Известно еще одно изображение сибирской эмблемы. На тарелке царя Алексея Михайловича вычеканены два соболя , стоящие задних лапах и держащие стрелу острием вниз. Тарелка датируется около 1675 года.

Эмблема Сибири, изображенная в первом  Титулярнике  русском была утверждена в 1729 году в качестве официального герба Сибири: «два соболя  черных,  стоящих на задних ногах , держат лук и корону золотые, меж ими две стрелы черные, а перья и копья красные, поле белое».       

В 1696 году казак Алексей Ножкин сообщил об открытии медной руды, в пяти днях  езды от Томска на реке Коштак было найдено месторождение серебра. Началось строительство металлургических заводов.

В  мае 1729 года были Высочайше утвержден первый Томский герб: "Человек, стоящий в рудокопне с рудокопательным инструментом в руках, поле желтое."Но богатых  залежей рудных ископаемых в окрестностях Томска не нашли. Томск не стал промышленным центром. Появляется новый герб.

В 17 веке через Томск пролег знаменитый Московский тракт .  Извоз и разведение лошадей  стало выгодным  делом. Отсюда и лошадь на гербе: "...в знак того, что лошади сей округи почитаются лучшими и что близь  живущих татар находятся конские заводы..."       

 В  1804 году Томск-центр обширной губернии.  Город получил новый герб: "В щите, имеющем зеленое поле, изображена белая лошадь,бегущая в правую сторону".    

По воле императора Николая Первого гербы губернских городов  увенчали императорской короной, а гербы старинных русских городов получили царскую шапку, а гербовые щиты  стали обрамляться дубовыми листьями с андреевской лентой.   

Губернский Томск  с 5 июля 1878  года получил герб, положенный ему по статусу.