Сибирский хаски имеет слой меха значительно толще, чем у других собак. Шкура у этих собак состоит их двух слоёв — плотный подшёрсток и верхний слой короткой прямой шерсти. Такой мех отлично защищает от плохой арктической погоды и низких температур — хаски могут выдерживать мороз до -60 градусов по Цельсию. В тёплом климате хаски, кстати, тоже не страдают — мех отлично отражает тепло. Хаски сильно линяют, поэтому их шерсть требует ежедневного ухода.
У породы множество вариантов окраски. Чаще всего у них белые лапы и белые пятна на морде и кончике хвоста. Наиболее распространённым вариантом является сочетание чёрного с белым, а так же рыжего с белым, серого с белым и чисто белый цвет. Очень редкими являются собаки золотистого оттенка, но большинство владельцев держит белых или пятнистых особей. Типичной, хотя и не обязательной особенностью породы является наличие маски вокруг глаз и пятен и полос по всему туловищу.