Важнейшими активными центрами, расположенными вдоль позвоночника, являются семь так называемых чакр. Они состоят из нервных узлов, кровеносных и лимфатических сосудов. Чакры — своеобразные аккумуляторы и одновременно генераторы биоэнергии ци. Каждой чакре соответствуют определенные вибрации; например цвет (длина волны) или звуки особой мантры (звуковые колебания). Нижние чакры (с первой по третью) резонируют с низкими частотами Земли, а верхние (с четвертой по седьмую) откликаются на высокочастотные колебания Космоса.
Таким образом, человеческий организм рассматривается как открытая система, входящая в общую энергетическую систему Земля-Космос. Индийские целители умели воздействовать на чакры с помощью драгоценных камней, которые также обладают определенными частотными характеристиками. На больные органы, точки или соответствующие чакры клали либо «иньские» камни, «вытягивающие» боль и ослабляющие избыточную энергетику, либо камни «янские», которые способны «подпитывать» энергией, возбуждать и стимулировать. В этом отношении методика древних восточных целителей в корне отличается от практики западных астрологов, подбирающих камни людям в соответствии с данными их гороскопов. Часто люди и не подозревают, что их недомогание связано с неверно выбранным ими украшением.
Ниже приводится список чакр с указанием драгоценных минералов, способных оказывать на них то или иное влияние.

Сахахасрара (в области темени): агат, алмаз, ангидрит, горный хрусталь, жемчуг, кахолонг, кальцит, кварц, топаз, флюорит, циркон, чароит

Аджна (на уровне середины лба):
агат, азурит, аметист, кварц, малахит, сапфир, флюорит

Вишудха (в районе горла):
агат, азурит, аквамарин, амазонит, апатит, бирюза, жемчуг, кошачий глаз, халцедон, чароит

Анахата (в районе сердца):
авантюрин, агат, актинолит, александрит, бело морит; берилл, гелиотроп, изумруд, диопсид, диоптаз, жадеит, змеевик, кальцит, лунный камень, малахит, нефрит, родонит, родохрозит, рубеллит, рубин, сагилит, серафинит, хризоберилл, хризопраз, чароит

Манипура (в районе солнечного сплетения):
агат, апатит, берилл, жадеит, змеевик, кремень, малахит, нефрит, оникс, тигровый глаз, хризолит, цитрин

Свадхистхана (священная, ниже пупка):
агат, альмандин, гематит, гелиотроп, рубин, шпинель

Муладхара (нижняя, в районе крестца):
агат, актинолит, гагат, гематит, гранат, обсидиан, раухтопаз

Каждая чакра имеет свой цвет.
Муладхара - черный, красный;
Свадхистхана - оранжевый;
Манипура - желтый;
Анахата - розовый и зеленый;
Вишудха - голубой;
Аджна - фиолетовый;
Сахасрара - белый, золотой.