Общеслав. Образовано, очевидно, с помощью суф. -ка от той же основы, что и щупать (сочетание пк > к). Рыба названа по своей «щуплости» (ср. с другими суф. диал. щупак, польск. szczupak). Вместе с тем нельзя полностью исключить предполагаемое некоторыми учеными родство с щель, скорняк, щерить, скука и др.
На самом деле слово образовано при зеркальном произношении
Щука=кусча (кусать)