Я пользовал практически на 100% аналогчную софтину Rocket Dock.

Основное ИМХО неудобство - в том, что нельзя полностью отказаться от стандартного виндового таскбара. Дело в том, что свернутые приложения попадают в док только в том случае, если они были явно свернуты нажатием соответствующей кнопки.

При этом если работать в каком-нибудь приложении, развернутом на весь экран, остальные окна, хотя и не свернуты, но так же и не видимы. Они показываются на виндовом таскбаре, но не показываются в доке.

Рискну предположить, что поскольку этот недостаток присущ всем подобного рода поделкам, которые мне приходилось видеть, он вызван особенностями Win32 API. А соответственно поделки эти остаются поделками.