Частенько ко мне в голову лезет мысль о том, что хорошо бы сделать заменитель капчи на основе мутируемого кода. Т.е. нажимаем кнопочку на js или флеше, которая выполняет некий код, формирующий дополнительные параметры. Такое уже много где есть, но код этот можно один раз расшифровать и делать бота. Смысл в том чтобы этот код был каждый раз разным, т.е. менялся в зависимости от каких-нибудь параметров, которые можно задавать случайным образом. По сути это обфускатор с широкими возможностями.

Это всё не спасёт, если бот работает с браузером и сам двигает мышку, но от парсинга исходников защитит на 100%.