Для главных героев фильма наступили будни в печали: Сэм потерял Микаэлу, правительство выпускает закон о выселении Автоботов с Земли, а пока Мегатрон прячется после позорного поражения Фоллена, десептикон Шокуэйв, правитель Кибертрона, готовится навестить нашу планету со злыми намерениями. Действие заключительной части кино трилогии на этот раз охватит не только планету Земля, но и наш спутник - Луну, темная сторона которой хранит такие же темные тайны.