Если говорить менее абстрактно, то по факту Xdebug мало чем отличается от, к примеру, стандартного Zend Debugger, единственно тем, что отлаживает скрипты на локальном компьюетере программиста. При установке Zend Platform это ограничение убирается. Возни с Xdebug очень много и цикл работы "запустил - запрофилировал результат - посмотрел - исправил" с ним значительно дольше чем со встроенными дебаггерами, т.к. приходится открывать дополнительные окна, обновлять их и тп, когда при работе с Zend Debugger можно все это сделать двумя кликами и хот-кеями.
Да, конечно, диаграммы, получаемые с пом. cachegrind очень наглядные и красивые, но это вообщем-то приятное излишество в отладке.
В чем поддержу использование xdebug - в том, что полезен вывод backtrace и для любителей - отслеживание вызовов функций (это действительно возможности, которые в стандартных дебаггерах отсутствуют), в остальном возня с ним едва окупает его возможности. По сравнению с готовыми IDE и встроенными debugger'ами.