Родился в Падуе, отсюда его прозвище Πадовинино («Падуанец»). Сын местного художника и архитектора Дарио Варотари. Учился живописи у своего отца, младший брат Кьяры Варотари.

Позже копировал фрески Андреа дель Сарто в Падуе. Создал ряд картин под влиянием Тициана. Особенно хорошо ему удавались детские фигуры и пейзажные мотивы.

К 1614 году переехал в Венецию. Он, как известно, дважды посетил Рим — в середине 1610-х и 1625 гг., где копировал картины художников Возрождения — Микеланджело, Аннибале Карраччи и др.

Среди лучших его полотен — «Брак в Кане», хранится в Венецианской академии, здесь же имеется ещё несколько его картин, а также холст «Победа кельтов над норманнами». Оригинальную трактовку античного мифа художник предложил в картине «Марс и Венера играют в шахматы».

Работы Варотари встречаются в европейских музеях; одна из них: «Эвмен и Роксана» — в петербургском Эрмитаже.

Среди учеников Варотари были Пьетро Либери, Джулио Каприони и Бартоломео Скалигеро.