Возможно в своих грехах действительно каятесь, всем сердцем, эмоционально, поэтому и перед исповедью такая реакция. Если Вы эмоциональный человек, то тут может быть такое объяснение, для Вас это действительно важно. В храме может быть плохо, всё-таки это помещение, хоть и наполненное Святым Духом...а у нас-то всё-таки биологическая оболочка есть, реагирует на недостаток воздуха. Подумайте, может быть Вы себя так чувствуете не только на исповеди и молитве, а если какие-то события, которые Вас эмоционально задевают на работе, с родными - и чувствуете подобно...если да - то тут физиология, особенности организма...Батюшка прав, если чаще ходить в церковь - быстрее адаптируетесь...
Да, иногда тяжело причащаться или вообще находиться на праздниках, хочется всей душой - но стояние, суета пробивающихся со свечками, недостаток воздуха...мы же всё-таки не терминаторы :-)...думаю Бог понимает нас, когда просто здоровья не хватает на целую Литургию...ведь разрешено же сидеть больным и старикам, а мы все люди со своими особенностями организма...