3 сезон
Кейт очнулась на полу раздевалки. По предложению Тома она приняла душ и одела платье, после чего, к её удивлению, девушку отвели на пристань, где её ждал завтрак с кофе в компании Бена. На вопрос Кейт, к чему всё это, Бен ответил, что следующие две недели будут очень неприятными, поэтому он хочет, чтобы у неё осталось хотя бы одно хорошее воспоминание. Затем её посадили в клетку. («Повесть о двух городах», 1-я серия 3-го сезона).
Сойер и Кейт спасаются бегством
Чтобы усмирить Сойера, ему сделали инъекцию неизвестного препарата, который в случае повышения пульса якобы должен был спровоцировать остановку сердца. Более того, Бен пригрозил проделать то же самое с Кейт, если Сойер расскажет ей о случившемся. После укола Сойер к удивлению Кейт очень переменился: отказался бежать, когда ей удалось выбраться из клетки, и не сопротивлялся, когда его избивал Пиккет. Позднее Бен увел афериста на прогулку, где рассказал, что введенный ему препарат совершенно безобиден. От него же Сойер узнал, что их отвезли на другой остров, поэтому пытаться бежать бессмысленно. («Каждый сам за себя», 4-я серия 3-го сезона).
Когда Колин умерла на операционном столе, жизни Сойера стала угрожать опасность со стороны Пиккета. Зная об этом, Кейт сломала замок на его клетке и стала уговаривать товарища бежать. Он отказался и рассказал ей, что на самом деле они находятся на другом острове, и пути к бегству отрезаны. Тогда Кейт пробралась в клетку Сойера, и они занялись любовью, после чего он признался ей в любви. Затем пришел Пиккет с намерением убить Сойера. Его избили и уже приставили к виску пистолет, когда у Тома неожиданно заработала рация. Оказалось, что Джек приостановил операцию Бена и пообещал завершить ее только в том случае, если его друзей отпустят. («Я согласна», 6-я серия 3-го сезона). Забрав оружие Пиккета, Сойер и Кейт бросились бежать. Другие едва не настигли их, но беглецов выручила Алекс. Она же пообещала отвести их к лодке в обмен на спасение Карла. Позднее, когда они уже готовились вместе с Карлом к отплытию, их пытался остановить Пиккет, но Джульет застрелила его. («Не в Протленде», 7-я серия 3-го сезона).
Когда они благополучно высадились на своем острове, Сойер дважды разочаровал Кейт: он не препятствовал побегу Карла и не поддержал ее стремление собрать команду и немедленно выдвинуться на помощь Джеку. («Чужак в чужой стране», 9-я серия 3-го сезона). Вернувшись в лагерь, он обнаружил, что спасшиеся поделили его вещи. В особенности сожалея о потере спиртного, Сойер попытался возвратить свое добро, сразившись с Херли в пинг-понг, но проиграл. («Введите 77», 11-я серия 3-го сезона).