Та же хрень... я тоже ничего не поняла)))))))))

о боже, сразу как ночной кошмар Макарова вспоминается... а зачем тебе эти праймеры дались?
Наташ, я тебя поздравляю с наступлением весны, пусть это хоть иногда будет важнее праймеров )

весна по любому важнее! спасибо, и ты не забывай что в мире есть весна!
надо выбрать универсальные эубактериальные праймеры к участку 16sРНК, а их куча разных и не понятно по какому принципу найти то что нам нужно, информация везде противоречивая... потом еще определить где их заказать и сколько нам надо...

а никакие зарубежные коллеги этим не занимаются, чтобы спросить?
вообще откуда вы взяли, что вам нужны именно они? если это из каких-то уже опубликованных исследований, то авторов и надо терзать на этот счет.
А что этим никто кроме тебя не занимается что ли?

этим никто кроме меня не занимается потому что это и есть моя работа! то что нужно именно 16sрнк это понятно, это самый распространенный молекулярный подход к оценке микробиоценозов. но праймеры есть разные, кто-то их сравнивал и писал что типа для пресной воды лучше такие-то, там для почвы - такие-то, а у нас будут донные отложения, а по ним праймеры не сравнивали (или я не нашла). видимо придется случайным образом выбрать какой-нибудь праймер из статей про отложения да и все. и потерзать ольгу глебовну чтоб узнать как же их заказать...

а попробовать оба варианта наверное дорого, да?
но ведь кто-то же тебе это поручил, не может же быть ,чтобы никто ничего не понимая в этом, свалил все на плечи молодого сотрудника. Или может?...

пробовать даже не оба, а вариантов так 4-5 по хорошему строго рекомендуется. но да, конечно, - дорого!
а у нас все может быть :) ну, окончательное решение принимает начальник, но он обычно говорит "убедите меня в вашем выборе". так что в чем его "убежу", так и будет

Праймеры для донных отложений не сравнивались, значит надо выбрать тот, что лежит ближе... Может все же те, которые для пресной воды? Ведь у нас водоемы-то пресные.

Akademik75, есть вариант пары праймеров и из статей про воду, и про отложения. если не получиться тестировать несколько - возьму эту пару. а микробы в воде и в отложэениях все же разные, там же анаэробные условия...