Давно это было. Старая это история. Запретили бояре в граматах русских писать слово «хуй», и сметливые горожане начали вместо этого слова писать букву «х», а так как в кирилице буква ХЭ звучала как ХЕР наш великий и могучий приобрел новое слово, которое мы используем до сих пор. Только вот есть маленькая загвостка: то, значение этих слов, о котором вы подумали, неправильно…то о чем вы все подумали тогда называлось «уд», как и любые конечности человека или животного.