Родился 31 октября 1964 года в г. Цхинвале. Окончил среднюю школу 5. Работал электромонтёром в отделении связи. В 1980 г. стал чемпионом Грузинской ССР по вольной борьбе; мастер спорта. В 19831985 гг. проходил срочную службу в рядах ВС СССР. Поступил в Юго-Осетинский педагогический институт, который окончил в 1988 году по специальности «Преподаватель физической культуры». В институте был избран секретарём комитета комсомола, после чего работал в комсомольских структурах.
Во время событий грузино-осетинского противостояния (19901991) создал и возглавил боевой отряд защитников Осетии, вошедший в состав боевой группы Гри Кочиева.
С 1990 по 1993 гг. депутат Парламента РЮО.
В феврале 1997 года указом первого президента РЮО Чибирова Л. А. был назначен торговым представителем РЮО в Российской Федерации. Работал помощником депутата Госдумы Российской Федерации от РСОА А. Чехоева.
В результате президентских выборов в ноябре-декабре 2001 года стал президентом Южной Осетии, победив во втором туре (53 % голосов) Л. Чибирова.
Известен как политик, стремящийся объединить Северную и Южную Осетию в рамках Российской Федерации[1][2].
Как-то давно я видел президента физрука. Сам Кокойты на меня произвел отнюдь не приятное впечатление. Впечатление человека "своего", этакого авторитета. Правда сам он, как видно ,человек принципов. После разгона правительства 18 августа, Кокойты начинает восстановление республики. Показывает себя человеком строгим и деловым. Показывает достойно. Ищет трудолюбивых депутатов в парламент. Правда источники рассказывают, что так он лишь пытается повысить имидж среди населения (действительно, 53% - не очень серьезный результат для выборов).