У меня получилось редактировать с помощью редактора Bred3.0.3
Убрал ненужное во всех ссылках вот это: "../../../external.html?link=" (как показано на скрине) с помощью команды "Заменить" [500x] [500x]
Второе поле оставляем пустым, убираем все галки, жмем на кнопку "Все", сохраняем документ и пользуемся...
LibreOffice Writer вполне справляется. Правда я открыл сначала в браузере, скопипастил всё в новый документ. Обычные ссылки нормально правятся, там надо убрать "file:///external.html%3Flink" из пути.
Хуже ссылки с плюсиками, открываются для редактирования очень сложно.