Как показали результаты анализа, по сравнению с некоторыми другими видами растений, к примеру, виноградом и томатом, кофе таит большие семьи генов, которые связаны с производством алкалоидов и флавоноидов — соединений, которые отвечают за такие качества, как кофейный аромат и горечь бобов. Кофе также имеет расширенный набор N-метилтрансфераз — ферментов, которые участвуют в производстве кофеина.
Максимально тщательное исследование генов, отвечающих за производство кофеина, указало на то, что эти участки генома у C. canephora гораздо более похожи на остальных представителей рода кофе, чем на какао и чай, которые также производят кофеин. Этот факт позволяет предположить, способность к производству кофеина развилась у растений независимо друг от друга в ходе эволюции.
Почему сразу несколько разных растений стали производить кофеин — это отдельный вопрос, отмечают учёные в пресс-релизе университета Буффало. Возможно, это вещество позволяло им отпугивать насекомых или замедлять рост конкурирующих растений. Однако новые исследования показывают, что насекомые, как и люди, могут обрести кофеиновую зависимость, так что пока неизвестно, является ли производство этого вещества лучшим репеллентом.