Черные аисты обитают в лесной зоне Евразии, стараясь избегать людей.
В России чёрный аист населяет территорию от Балтийского моря через Урал по 60-61 параллели и всю Южную Сибирь до Дальнего Востока. На Курилах, острове Сахалин и полуострове Камчатка не встречается.
Отдельная популяция обитает на юге России, в лесах Чечни, Дагестана, Ставропольского края.
Наибольшее количество птиц в России гнездится в районе Приморья.
Зимует в южной Азии. В Южной Африке живёт оседлая популяция чёрных аистов.
Самая большая в мире популяция чёрного аиста обитает на территории заказника Званец, находящегося в Беларуси. Образ жизни чёрного аиста изучен слабо.
Эта скрытная птица предпочитает селиться в глухих, старых лесах на равнинах и предгорьях возле водоёмов — лесных озёр, рек, болот.
В полёте чёрный аист, как и другие аисты, часто парит, распластав крылья. Как и все аисты, чёрный летит, вытянув вперёд шею и откинув назад длинные тонкие ноги.
Питается в основном рыбой, мелкими водными позвоночными и беспозвоночными животными, кормится на мелководьях, заливных лугах и поблизости от водоёмов.
На зимовках, помимо перечисленного кормится мелкими грызунами, крупными насекомыми, реже змеями и ящерицами, моллюсками.