2 мая 1999 года Матрона канонизирована как местночтимая московская святая. В октябре 2004 года состоялась ее общецерковная канонизация. Частицы мощей святой Матроны доставлялись для поклонения в города России: в Вологду, Красноярск, Липецк, Новокузнецк, Пермь и др.
Блаженная Матрона Московская является одной из самых известных и почитаемых в России святых. К её мощам ежедневно приходят поклониться тысячи человек (в выходные дни очередь к мощам растягивается на 7—8 часов). Считается, что по её молитвам происходит огромное количество чудес и исцелений, включая невоцерковленных, и не православных людей, ведется запись письменных свидетельств этого. Специально, чтобы поклониться Святой Матроне, приезжают паломники из других стран. Чудотворная сила святой Матроны признана всей иерархией Русской Православной Церкви, включая Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Кирилла, который призывал всех обращаться к святой Матроне не только за помощью в решении жизненных проблем, но и даровании сил несения страданий.