В 1795 году, сразу же после присоединения Бельгии к Франции, в Брюсселе началась закладка первого ботанического сада, который было решено основать на месте бывшего дворца Coudenberg, вдоль внешней стены Брюсселя - в то время город был окружен по периметру крепкой кирпичной стеной.
Богатая коллекция местных и экзотических видов растений вскоре заслужила широкую известность, но из-за необходимости постройки новых жилых районов, этот сад нуждался в переносе на новое место. В 1826 году, по ходатайству пяти известных и уважаемых ботаников, сад переехал на новое место, с большим количеством красивых лесистых участков, открытых пространств с хорошо увлажненной плодородной почвой, которая была необходима для полноценного роста и развития растений.