Ватиканские сады, занимающие общую площадь более чем в 20 гектаров, покрывают преимущественно Ватиканский холм, возвышающийся над окрестностями более чем на 60 метров. В севера, юга и запада Сады ограничены Ватиканской стеной. На территории Садов имеются несколько родниковых источников, в Средневековье при нужде снабжавшие водой Ватикан, а также питавших субтропическую, произрастающую здесь и поныне растительность. Большая часть Садов разбита и ухожена человеком; обширные газоны расположены прежде всего на равнинных площадях перед Собором святого Петра и Ватиканскими музеями. Значительная часть их была создана по указанию пап ещё в эпохи Возрождения и барокко. Наиболее сохранившейся, «природной» частью Ватиканских садов является территория между Леонинской стеной и зданием, где находится администрация Ватикана. Она представляет собой плотные заросли различных деревьев: пиний, сосен, дубов, кипарисов, пальм и др., покрывающих эту холмистую местность. Через сады проложено множество дорог и тропинок. В западной части Ватиканских садов находится Ватиканский гелипорт (открыт в 1976 году), соединяющий Папское государство с римскими международными аэропортами Фьюмичино и Чампино.