Во время пребывания Двора в Царском Селе воспитанники Пансиона, как и Лицея, и как все посторонние лица, жившие в Царском Селе, ходили к обедне в дворцовую Воскресенскую церковь.

Эдуард Гау. Церковь Большого Царскосельского дворца (Воскресения Христова), 1860

6-рядный иконостас и оформление Царских врат в алтарь

Только после пожара дворца в 1820 году и во время переделки дворца и церкви, равно большею частию в отсутствии Двора из Царского Села, когда не всегда бывала служба в дворцовой церкви, воспитанники Пансиона ходили в Знаменскую возле Лицея бывшею тогда приходскою, а иногда и в Софийский Собор Лейб-Гвардии Гусарского полка, находившийся тогда совершенно в поле.

Знаменская церковь, менее пафосная и уютная в стиле петровского барокко.

Знаменская церковь памятная тем, что каждый день лета 1761 года императрица Елизавета Петровна пешком ходила из дворца в приходскую Знаменскую церковь. 8 сентября, в праздник Рождества Пресвятой Богородицы, во время службы она почувствовала себя дурно, вышла на улицу и упала без чувств на траву. Ее привели в сознание и отнесли во дворец. В декабре она скончалась.

В церкви находилась икона «Знамение», некоторые пушкинисты считают, что именно о ней говорится в стихотворении А.С. Пушкина 1830 года «В начале жизни школу помню я…».