В центре сюжета данного сериала оказались люди-мутанты, от которых отреклись все окружающие после неудачного эксперимента, проводившегося в области генетики. Из-за научных опытов, которые в строгой секретности проводились под руководством правительства, они приобрели сверхспособности. Но, осознав, что все идет не так, как надо, организация, по заданию которой были созданы эти необычные люди, теперь хочет избавиться от них. Ученый по имени Адам, участник создания этой программы, решает помочь бедолагам. Он организовывает свою команду, в которую входят четыре мутанта «Мутанты Икс». Их задание - отыскать других мутировавших и помочь им в управлении своими сверхспособностями, а также спасти себя и других от своих разработчиков, а именно от своего коллеги Адама и от Мейсона Экхарта.