В основном здании в экспозиционных аквариумах - около 40 видов рыб литовских рек, озер, а также Балтийского моря: сомы, голавли, усачи, хариусы, угри, чехонь, сиги и др. Плавают тропические пресноводные рыбы, особо поражает живущая тут свыше десяти лет громадная мурена. Несколько аквариумов отданы беспозвоночным животным коралловых рифов: морским звездам, моллюскам, морским ежам и др. В экспозиции морской фауны - самая богатая в Литве коллекция кораллов и раковин, среди них весьма редкие, привезенные из дальних стран. Препарированные морские животные представлены согласно научной систематике, начиная с губок и кончая морскими птицами и млекопитающими. В этом музеи можно фотографировать и фотографировать, но лучше увидеть своими глазами!