Вообще, как мне кажется, эту фразу чаще говорят девушки, но я могу и ошибаться. На данный момент по моему опыту мне известны четыре реакции (но 100% их гораздо больше):

Реакция №1. Согласие.
Ситуация:парень влюблен в девушку, но он же ей просто нравится. на её "мы можем быть только друзями" парень соглашается и они, иногда, гуляют, болтают по телефону, обмениваются дисками и тд - общаются как друзья в общем.
Понимание:как мне кажется, когда парень действительно заинтересовался девушкой, то предложение быть только друзьями не будет воспринято в штыки, так сказать. в конце концов это возможность узнать друг друга лучше и надежда, что когда-нибудь могут стать и больше чем друзьями.

Реакция №2. Ну и ладно.
Ситуация:познакомились парень и девушка (не важно где). пара свиданий и она говорит "мы можем быть только друзями". парень просто исчезает.
Понимание:ну явно, что не так уж и нравилась девушка парню. может быть он и с ней познакомился просто так, ни на что не расчитывая.

Реакция №3. Либо люби, либо вали.
Ситуация:познакомились парень и девушка. хорошо общаются. думают, что влюбленны друг в друга. но девушка неожиданно выдает, что "мы можем быть только друзями". парень "я не умею быть тебе другом". в итоге они расстаются, и будто и не знали никогда друг друга.
Понимание: тут тоже получается, что парень либо не так уж и был влюблен (может просто увлекся), либо он максималист (либо люби, либо вали и среднего не дано), либо он очень оскорбился. а в итоге мучаются оба: она от чуства вины и/или от того, что сама возможно не может понять, что к нему чувствует; а он негодует, ведь всё вроде было хорошо, а тут такой "сюрприз".

Реакция №4.а. Западло.
Ситуация:парень и дувушка встречаются, но однажды она говорит "мы можем быть только друзями". он соглашается, но обида и ревность выедают его изнутри: он делает ей всякие гадости, мелкие пакости, пытается подставить её, как-то унизить.
Понимание:ну, такой парень, похоже жуткий собственник, у которого отняли его вещь, так сказать. если гадости, которые он делает переходят всякие границы, доходят до физического насилия, то скорее всего с психикой у него не всё в порядке.

Реакция №4.б. Западло.
Ситуация, аналогична 4.а, но на этот раз девушка и парень меняются положением: она вредит.
Понимание:здесь уже просто женская месть и обида,может даже собственничество, но расстройство психики тоже возможно.

В последних трех реакциях (3, 4.а, 4.б) лучше всего объяснится с друг другом, выложить всё на чистоту, чтобы не оставалось обиды, неприятного осадка от "мы можем быть только друзями".

Всё, что я здесь настрочила - это всего лишь моё понимание таких вещей. в конце концов я не психолог и не собираюсь им становится, но это мой опыт, опыт моих друзей. это всё как бы обобщение этого опыта. и мне просто захотелось им поделится что ли*) хотя, наверно, вы и сами всё это прекрасно знаете ^_^