Похоже, что samba (от названия протокола SMB, если кто не в курсе) таки поистине обременена родимыми пятнами винды как таковой со всеми вытекающими последствиями. Поэтому во избежание мозготраха с проблемами взаимодействия виндовых машин с самбовским контроллером домена следует запомнить одну простую истину: в любой непонятной ситуации перезагружай PDC-самбу. 8-)
По крайней мере это касается самбы версий 3.х, в которой существуют и другие проблемы. Возможно, в самбе 4.х, реализующей AD, подобных граблей и не существует, но уже само наличие редактора реестра (sic!) для 4.х наводит на печальные размышления о судьбах этого мира.