В предыдущей заметке было написано как можно открыть и прочитать  документы новых версий Word, Excel и PowerPoint на компьютере со старыми версиями пакета Microsoft Office. Однако бывает другая ситуация  когда Вы получаете документ, созданный в пакете OpenOffice, и его надо открыть на компьютере где установлен только Word, Excel и PowerPoint от Майкрософт. В этом случае Вам нужна специальная программа, которая произведет конверсию документов OpenOffice и позволит прочесть их в Microsoft Office. Раньше эта программа конвертации была бесплатной и свободно доступна для скачивания, но после того как OpenOffice купила корпорация Oracle, эта программа версии 3.2 продается по немыслимым ценам. Однако ее свободно распространяемую версию (3.1  созданную еще до покупки Oracle) можно найти на многочисленных зеркалах и файловых архивах по этому запросу Google.

Часто в отделении бывает ситуация, когда компьютеры покупаются не все сразу, а появляются с интервалом в пару лет. При этом обычно на компьютере устанавливаются и программы для работы с текстовыми файлами, электронными таблицами и презентациями разных версий. Чаще всего используется пакет программ от Майкрософт, включающий Word, Excel и PowerPoint (хотя в ряде отделений и стоит свободно распространяемый пакет программ OpenOffice, во многих отношениях не уступающий продуктам Майкрософт, и главное  бесплатный). При этом форматы разных версий Word, Excel и PowerPoint не совместимы между собой, то есть Word 97 версии не сможет прочесть файл, сохраненный в формате Word 2002 или Word 2007. Это создает множество неудобств, потому что надо либо сохранять все файлы в более старом формате, либо бегать по всей больнице и искать компьютер с новой версией офиса.

К счастью, из этой ситуации есть выход.

Читать далее...

Один из афоризмов гласит Кто владеет информацией  тот владеет миром. Применительно к медицине владение информацией зачастую равнозначно правильному проведению диагностики и назначению наиболее эффективного лечения с минимальным побочным действием.

Самая актуальная информация для врача содержится в оригинальных статьях в медицинских журналах. Литературные обзоры в этих же журналах обычно появляются через год и более после публикации оригинальных исследований. В клинические руководства и монографии данные из статей попадают в лучшем случае через 1-2 года после публикации, а в учебниках для ВУЗов или методические пособия  зачастую еще позже (через 5 и более лет после публикации результатов того или иного исследования).

Доступ ко многим журналам ограничен подпиской, которая предполагает обязательную предоплату для возможности ознакомиться с результатами опубликованных в журнале статей. Издателей понять можно  им необходимо получать средства на работу редакции, типографии и т.д. В тоже время такая политика ограничивает, или полностью лишает многих врачей доступа к актуальной информации о методах профилактики, диагностики и лечения (особенно в развивающихся странах и странах, в которых зарплата врача недостаточно высока чтобы позволить себе подписку на журнал).

Существуют три возможных решения этого противоречия между потребностью в информации и ограничениями на ее распространение.

Читать далее...

По данным опубликованной в Lancet статьи Gakidou и соавторов,  рост уровня образованности матерей предотвратил смерть 4,2 миллионов детей младше пяти лет во всем мире за период с 1970 по 2009 гг.

В России среднее число лет образования составило среди женщин 5,7 лет в 1970 г., 9,7 лет в 1990 г. и 12,9 лет в 2009 г. Среди мужчин среднее число лет образования составило 6,8, 10,2 и 12,7 лет, соответственно.  Таким образом, Россия следует тенденции стран с высоким уровнем дохода, для которых характерно не только выравнивание средней длительности образования среди мужчин и женщин, но и большее число лет образования среди женщин в последние десятилетия.

Остается только догадываться как может повлиять на продолжительность и качество обучения, и, самое главное, на детскую и младенческую смертность недавняя инициатива Минобрнауки сократить 200 тысяч учителей по всей России.

Из позитивного  график среднего числа лет образования среди мужчин и женщин в 1970 (А) и в 2009 (В) годах во всем мире из Lancet.

[показать]

Найденные в блоге доктора Topf прекрасные видеоруководства библиотеки клиники Мейо о том как работать в Медлайн (Medline, Pubmed). Это искусство  вместить столько в 12 минут.

PubMed Advanced Search: An Introduction

My NCBI-Custom Filters and Sharing Collections

В предыдущей заметке речь шла о текущем резервном копировании, предназначенном для защиты данных от потери до или после их существенного изменения (например, написания нового раздела статьи или дополнении таблицы с данными новыми переменными).

Однако при работе с данными возникает также необходимость планового резервного копирования. Например, если Вы ведете список поступивших и выписавшихся в отделение больных, то он изменяется практически каждый день, и делать резервную копию вручную не очень удобно. Либо, если Вы печатаете для каждого больного выписной эпикриз на компьютере, и все выписки хранятся в отдельном каталоге (папке), удобнее с определенной периодичностью делать полную резервную копию этой папки (например, раз в неделю или раз в месяц). Это же может относиться к протоколам диагностических исследований, или локальной базе данных с которой Вы постоянно работаете.

Итак, для постоянно изменяющихся данных необходимо делать плановое резервное копирование в автоматическом режиме. Его смысл состоит в том, чтобы однократно настроить специальную программу делать резервную копию с заданной частотой (например, в понедельник в 20-00, или первого числа каждого месяца в 12-30, или по вторникам и четвергам в 9-15). После этого, вне зависимости от того, помните Вы об этом или нет, программа будет делать резервные копии в определенное Вами время.

Читать далее...

Минздрав опубликовал проект нового перечня жизненно-важных лекарств. Вроде бы по нефрологии сохранили все что было в старом перечне, и добавили базиликсимаб.

Видимо под влиянием летних впечатлений также включили антидот к угарному газу цинка бисвинилимидазола диацетат [показать]

Дополнение от 15 октября  включены еще 6 препаратов, не нефрологического профиля.

Приятные ироничные (подчас) комиксы http://abstrusegoose.com/

[показать]

В NEJM опубликована статья Solomon и соавт. с данными вторичного анализа исследования TREAT (в которое вошли 4038 пациентов с диабетической нефропатией, не требующие диализа). Отвлекаясь от содержания самой статьи, следует отметить что все публикации NEJM для жителей России доступны в полнотекстовом бесплатном режиме.

Авторы выделили группу больных с недостаточным ответом на терапию дарбэпоэтином (которая определялась как увеличение уровня гемоглобина менее 2% в течение первого месяца лечения дарбэпоэтином) и сравнили их начальные показатели и частоту исходов с другими группами пациентов с большим ростом уровня гемоглобина. Выяснилось, что у пациентов с недостаточным ответом на терапию в течении пятилетнего наблюдения чаще развивались кардио-васкулярные осложнения и была выше летальность. Эти же пациенты в целом имели более низкий гемоглобин, и им требовались более высокие дозы дарбэпоэтина для его достижения как в ранний период, так и после 12 недели терапии. Тогда как в группе с хорошим ответом на дарбопоэтин гемоглобин был в целом выше, а дозы дарбэпоэтина ниже. На этом основании авторы задаются вопросом в какой мере собственно уровень гемоглобина может быть ответственен за увеличение частоты осложнений при попытке его нормализации у больных с хронической болезнь почек (ХБП). Ответ на этот вопрос могут дать только дальнейшие исследования, и в настоящее время по-прежнему актуальной остается рекомендация по оптимальному уровню гемоглобина у больных с ХБП 110-120 г/л.

Есть несколько вопросов, которые в статье Solomon с соавторами не были освещены или в достаточной мере обсуждены. Приведенные ниже соображения ни в коем случае не умаляют важности статьи, а скорее являются примером критической оценки публикации в медицинской литературе.

Читать далее...

[показать]

Стартовала новая фаза всемирного исследования Global Burden of Diseases, Injuries, and Risk Factors Study 2010, которое посвящено изучению эпидемиологии всех заболеваний, травм  и факторов риска.

Вы можете принять участие в этой фазе исследования, ответив на вопросы по Вашей оценке тяжести различных состояний и мер по их профилактике. Все вопросы на английском, участие бесплатно и открыто для всех. Цель данной фазы  получить ответы от по крайней мере 50,000 человек для упорядочивания различных заболеваний, травм, состояний по степени их влияния на качество жизни и восприятие болезненности.

Само исследование Global Burden of Diseases, Injuries, and Risk Factors Study 2010 возглавляет консорциум Института мониторинга и оценки здравоохранения Вашингтонского университета (Institute for Health Metrics and Evaluation of the University of Washington), Всемирной организации здравоохранения (World Health Organization), Гарвардской школы публичного здоровья (Harvard School of Public Health), департамента международного здоровья школы общественного здравоохранения им. Д.Хопкинса (Department of International Health at the Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health), и школы общественного здравоохранения университета Квинсленда (School of Population Health of the University of Queensland).

Более подробно об исследовании в целом можно прочесть на сайте globalburden.org

В дополнение к заметке о прямом влиянии увеличения уровня образованности матерей на детскую смертность  график зависимости абсолютных показателей детской смертности от числа лет образования женщин репродуктивного возраста. Источник  коллектив авторов статьи в Lancet из Вашингтонского университета.

[показать]

Минздравсоцразвития на днях опубликовал программу госгарантий оказания бесплатной медицинской помощи россиянам на 2011 год. Это рамочный документ с указанием среднего норматива по количеству и цене разных видов медицинской помощи на каждого россиянина. Местные бюджеты субъектов федерации, отдельных областей или городов вольны вносить свои дополнения в то, какой и сколько медицинской помощи они обеспечат гражданам на их территории. Поэтому чтение программы госгарантий дает не очень правильное представление о реальной картине и региональных различиях в оказании мед помощи, но все же ряд вещей в ней интересен. И, конечно же, более информативно посмотреть на все эти показатели в динамике, для чего я и составил таблицу за 2008-2011 года по программе госгарантий. Кроме того, в таблице приведены данные Минэкономразвития и Росстата по инфляции, изменению цен на аспирин и нитроглиценрин, а также цены бензина.

Работая над статьей, презентацией, базой данных или таблицей статистических программ  всегда делайте резервное копирование этих данных.

Резервное копирование можно разделить на текущее и регулярное. Текущее резервное копирование Вы можете делать по мере необходимости, например, перед или после существенного дополнения статьи, изменения презентации, внесении в таблицу SPSS новых переменных и т.д.

Таким образом, если Вы сделали резервное копирование перед изменением данных, то у Вас всегда будет оставаться файл с исходными данными, к которым Вы всегда сможете вернуться если удалите их в дальнейшем при изменении того же файла . Если Вы делаете резервное копирование после изменения файла, то у Вас всегда будет сохранен файл с Вашей последней правкой, и к нему можно будет вернуться если в дальнейшем файл с которым Вы работаете будет поврежден. Обычно в процессе работы я делаю однократное резервное копирование исходного файла, и далее после существенных изменений или дополнений файла  текущие резервные копии, таким образом сохраняются и старые версии файла, к которым можно вернуться, и самые последние изменения, защищенные от потери данных.

В этой заметке я расскажу как делать текущее резервное копирование при помощи программы WinRar.

Читать далее...

В New England Journal of Medicine от 7 октября вышла обзорная статья, посвященная отторжению почечного трансплантата. Весьма сжато представлены классификация, патогенез основных типов отторжения и направления для будущих исследований. Статья прекрасно проиллюстрирована как схематическим представлением распознавания антигенов иммунной системой, острого отторжения опосредованного антителами, острого отторжения опосредованного Т-лимфоцитами, хронического отторжения, так и фотографиями почечных биоптатов при различных типах отторжения.

Для практического врача статья во многом носит ознакомительный характер, поскольку несмотря на изложение патогенеза и морфологические иллюстрации, не содержит данных о применении индукционной или поддерживающей иммуносупрессии.

Моя лекция по оценке адекватности и дозы программного гемодиализа 2007 года.

[показать]

[показать]

[показать]

[показать]

Читать далее...

Нашел в блоге медицинского статистика Сошникова видеоуроки Мичиганского университета о том как работать в программе SPSS.

Представлены практически все аспекты работы с SPSS  формирование таблиц с данными, сортировка, выборка, трансформация данных, работа с разными окнами SPSS, параметрические и непараметрические тесты, линейная и логистическая регрессии, кластерный и факторный анализы, анализ выживаемости (однофакторный Каплана-Майера и многофакторный Кокса), характеристическая кривая. Есть раздел по контролю качества данных на предмет выпадающих значений (которые подчас обусловлены неправильным вводом данных).

Немаловажно для начинающих, что к каждому видеоуроку можно скачать данные в формате SPSS, на основании которых он построен, и сравнить полученный результат с приведенным в ролике.

Все видеоуроки на английском.

Индекс коморбидности Charlson [4] был предложен авторами специально для оценки прогноза больных с длительными сроками наблюдения. Он представляет собой бальную систему оценки возраста и наличия определенных сопутствующих заболеваний. При его расчете суммируются баллы, соответствующие сопутствующим заболеваниям (таб.), а также добавляется один балл на каждую декаду жизни при превышении пациентом сорокалетнего возраста (т.е. 50 лет – 1 балл, 60 лет – 2 балла, и т.д.). Пациенты, находящиеся на лечении ГД, изначально имеют значения индекса “2” непосредственно за счет наличия терминальной хронической почечной недостаточности.

К сожалению, индекс коморбидности Charlson имеет некоторые недостатки – при его расчете не учитываются наличие стенокардии и стадия сердечной недостаточности, ряд других прогностически важных заболеваний. Тем не менее, в предшествующих исследованиях установлена хорошая прогностическая ценность индекса коморбидности Charlson у больных на диализе [1-3, 5, 6]. По сравнению с другими методиками расчета индекс коморбидности Charlson показал наилучшую прогностическую ценность при анализе выживаемости больных на программном гемодиализе [7].

Таблица. Бальная оценка наличия сопутствующих заболеваний при расчете индекса коморбидности Charlson

Пример.

Больной И., 63 лет, находится на лечении ГД с 19/03/01. Диагноз: диабетический нефросклероз, Хронический пиелонефрит. Сахарный диабет 2 типа, Инфаркт миокарда от 15/08/02, Стенокардия напряжения 2 ф.к., Артериальная гипертензия.

Расчет индекса коморбидности Charlson:

В медицинской литературе широко используются понятия медиана и интерквартильный размах, а в представлении данных – ящичковые диаграммы. Ниже мы приводим разъяснения по этому поводу.

В медицинских публикациях при описании данных чаще всего можно встретить представление числовых значений (например, артериального давления, уровня гемоглобина, возраста и т.д.) в виде среднего и стандартного отклонения, что отражается как М±

Вчера прошла сессия Всемирной организации здравоохранения в Москве. Из материалов по теме впечатляют данные по индексу развития человеческого потенциала (как интегрального показателя бедности, грамотности, образованности и долголетия) из доклада по развитию регионов России 2007 года (значения самого индекса приведены за 2004 год).

Рис. 1. Индекс развития человеческого потенциала в регионах России

[показать]

Рис. 2. Доля населения России в зависимости от индекса развития человеческого потенциала

[показать]