Со словом "наверное" постоянно связаны некоторые сомнения, и запятые, которые, как кажется, необходимы по официальным правилам, на слух воспринимаются лишними.
Как, к примеру, оформить такое:
... и пусто в комнате, и, наверное, не стоит из-за этого огорчаться...

https://pishu-pravilno.livejournal.com/4930810.html