ВОЗ утверждает, что дым от кальяна, в отличие от сигаретного, не раздражает слизистых оболочек горла или носа курильщиков. Различные научные исследования показали, что фильтрование дыма табака через воду в кальяне сокращает содержание никотина, фенолов (до 90 %), мелких твердых частиц (до 50 %), бензопирена, а также ароматических углеводородов полицикликена. Однако некоторые другие ученые утверждают, что дым кальяна, профильтрованный водой, все же содержит достаточное количество других веществ, чтобы признать его вредным. Большинство же медработников сходятся во мнении, что нельзя сравнивать кальян и обычные сигареты. Для здоровья опасно и то и другое.