Датой основания Белогорского краеведческого музея считается 1959 год. В 1953 году в средней школе №3 города Куйбышевки-Восточной, под руководством учителя географии Ельченинова Николая Георгиевича, сформировалось школьное географическое общество "Глобус". С 1953 года по 1961 год учащиеся школы совершили 48 многодневных походов, более 150 однодневных походов, провели 280 экскурсий на промышленные предприятия города, в колхозы и совхозы Белогорского района. Юные краеведы побывали в 51 населенном пункте, создали карту Белогорского района. Собранный материал в 1959 году оформили в виде витрин и стендов в  музее на втором этаже школы.
     В 1960 году основателем музея Н.Г. Ельчениновым на юбилейной сессии, посвященной 100-летию города, экспонаты были переданы городу для создания городского музея. Открытие городского музея состоялось 16 октября 1961 года в здании Дома пионеров (потом музыкальная школа).  В 1982 году музей переехал в пристроенное помещение к дому по ул.Кирова 117, где и находится в данный момент. Т.к г.Куйбышевка-Восточная в 1957 году был переименован в г. Белогорск, музей стал называться Белогорскийм краеведческим музеем на общественных началах. В декабре 1980 года приказом МК РСФСР музею было присвоено звание народного.
    С 1987 года народный музей г. Белогорска стал филиалом Амурского областного краеведческого музея им. Г.С. Новикова-Даурского. Одним из главных направлений его деятельности является комплектование фондов. В музее пять экспозиционных залов. Больше всего посетителей привлекает зал "флора и фауна Амурской области". Также очень интересна экспозиция "Гражданская война в Амурской области 1918-1920 гг.", где на основе документов, схем, диаграмм, вещественных источников рассказывается о завоевании и установлении Советской власти в Амурской области и в нашем городе. Неотъемлемой частью работы музея является выставочная деятельность. Ежемесячно проводятся тематические стационарные выставки. Тематика выставок разнообразна: от новых поступлений до выставок декоративно-прикладного искусства.
    В 2000 г. музей приобрел статус юридического лица. В 2005 г. открылся новый зал "Боевой и трудовой славы" , посвященный 60-летию победы в Великой Отечественной войне. В этом же году музей объединен с "Галереей искусств"