Родился, жил и работал в Испанских Нидерландах. Старший брат Герарда Зегерса (у них разница в один год). Учился рисовать цветочные натюрморты в мастерской Яна Брейгеля Старшего.

В 1611 году вступил в антверпенскую гильдию художников и получил звание мастера, а в 1614 году — в Орден иезуитов. Благодаря поддержке Ордена совершил поездку в Рим, и достаточно длительное время там обучался мастерству живописи. В тот период писал цветочные гирлянды вокруг мадонн и изображений святых на полотнах учеников Рубенса — Абрахама ван Дипенбека, Корнелиса Схюта, Эразма Квеллина Младшего и других. Изображал также цветочные натюрморты, цветы в вазах и букеты. Часто сотрудничал с другими художниками, например, с Эразмом Квеллином Младшим и Корнелисом Схютом. После смерти своего учителя Брейгеля Старшего стал ведущим мастером цветочного натюрморта в Антверпене.

Современники прославляли искусство художника в стихах и прозе. Кардинал-инфант Фердинанд (1635), эрцгерцог Леопольд Вильгельм (1648) и будущий английский король Карл II (1649) посещали мастерскую художника в Антверпене.

Краски полотен Зегерса ясные и светлые, при этом художник не злоупотреблял пестротой и многоцветием, картины отличаются тщательностью проработки деталей. Его произведения экспонируются во многих музеях Бельгии, а также в картинных галереях Лондона, Мадрида, Толедо, Вены, Мюнхена, Дрездена, Гааги и других городов.