Анимация сделана при помощи фильтра Constellation плагина Alien Skin Xenofex 2.
Только здесь применяются промежуточные кадры для плавного перехода, да и сами слои с фильтром стоят в режиме "перекрытие".
1. На отдельном слое обводите кисточкой участки анимации.
2. Дублируете три раза рисованный слой и применяете фильтр с разными настройками.
Режим слоёв либо "мягкий свет", либо "перекрытие".
3. При создании анимации применяете промежуточные кадры (2-3) не больше.