Согласно завещанию герцога Омальского, ни один предмет из его коллекций не может быть вывезен за пределы усадьбы Шантийи, а постоянная экспозиция не должна изменяться. Залы музея выглядят в настоящее время так же, как в год его основания (1898). Каждый год музей принимает около 250 000 посетителей. В течение года в музее проводятся четыре временные выставки, на которых можно увидеть часть произведений, обыкновенно хранящихся в запасниках.

Большие галереи
Большие (Великие) галереи были названы герцогом Омальским в честь Великого Конде. В них располагается картинная галерея музея. Уже при строительстве замка этим помещениям было предназначено стать музейными.

Зал Оленей (Оленья столовая)
Этот зал назван так же, как и помещение, построенное в 1528 году в старом замке Анна де Монморанси.

Он построен между 1875 и 1880 годом и был торжественно открыт 11 ноября 1880 года.

Зал с балконом для размещения музыкантов при герцоге Омальском использовался как парадная столовая.

На потолке, декорированном кессонами, как было принято в XVI веке, изображены гербы хозяев Шантийи.

Все остальные украшения зала связаны с темой охоты.

По стенам развешаны шпалеры из цикла «Охота императора Максимилиана в окрестностях Брюсселя» — реплика знаменитой фламандской серии XVI века, выполненная по заказу Людовика XIV на Мануфактуре Гобеленов для его внебрачного сына графа Тулузского. Оригинал в настоящее время находится в Лувре.

На шпалерах представлены сцены придворной охоты в разные времена года В Оленьей столовой проводятся временные выставки графических произведений.

Картинная галерея (Большая галерея живописи)

Большая галерея живописи  является крупнейшим выставочным залом музея. Галерея освещается верхним светом, её стены отделаны «помпейским красным». Картины размещены так называемой «салонной развеской».

Здесь экспонируются в основном крупноформатные произведения, которые до восстановления замка находились в Зале для игры в мяч.

За картинной галереей находится ротонда, которая расположена в башне Vineuil. В ротонде герцог Омальский первоначально разместил свою коллекцию графики, которая впоследствии, во избежание порчи, была убрана из постоянной экспозиции. Место графических произведений заняли несколько знаменитых картин, в том числе «Портрет Симонетты Веспуччи» Пьеро ди Козимо и «Мадонна с вуалью» Рафаэля, атрибутированный художнику только в 1979 году.. Мозаика на полу с охотничьей сценой обнаружена при раскопках Помпей, вероятно происходит из Casa dei Fiori

По левой стороне представлены картины итальянской школы, начиная с Гверчино, а также произведения которые были созданы в Италии, например, работы Никола Пуссена или Гаспара Дюге.

Правая сторона отведена под образцы французской живописи, в том числе картины Филиппа де Шампеня, Натье и Эжена Делакруа, а также произведения ориенталистов. В глубине зала экспонируются работы художников XVIII века

Франсуа-Юбер Друэ, портрет Марии-Антуанетты

Жан-Батист-Камиль Коро -Деревенский концерт

Жан-Франсуа де Труа - Обед с устрицами

Фердинанд Виктор Эжен Делакруа, Два Фоскари, 1855

«1805 г., кирасиры перед атакой Месонье»

Галерея Психеи. Святилище. Кабинет драгоценных камней
Галерея Психеи украшена 44 витражными окнами, на тему античного мифа о Психее.

Витражи были созданы между 1541 и 1542 годами по заказу Анна де Монморанси для его замка Экуан

В зале, стены которого обиты зелёной тканью, проводятся временные выставки, иногда также занимающие кабинет драгоценных камней и Оленью галерею. Сантуарио (с итальянского: «святилище») — это небольшая комната с верхним светом, устроенная между 1886 и 1889 годами, ранее здесь находился кабинет гравюр и рисунков, которые впоследствии из соображений лучшей сохранности были убраны. С тех пор в этой комнате хранятся две картины Рафаэля: «Три грации» и «Орлеанская мадонна», панель от кассоне с росписью Филиппино Липпи «Эсфирь и Артаксеркс», а также 40 миниатюр Жана Фуке из Часослова Этьена Шевалье

В Кабинете драгоценных камней хранятся оружие и ювелирные коллекции, а также портретные миниатюры.

Здесь экспонировался розовый бриллант «Великий Конде», полученные, возможно, в дар от Людовика XIV. В настоящее время в кабинете экспонируется его копия. Также в Кабинете экспонируются портретные миниатюры.

Ля Трибюн

Этот зал назван в честь зала в галерее Уффици во Флоренции, который был создан в 1580-х годах Бернардо Буонталенти. Высокое помещение с верхним светом имеет такую же форму шестиугольника, как и зал в Уффици, и так же задрапировано красным бархатом, украшенным плетёными галунами.

Под самым потолком висят восемь картин работы лауреата римской премии Армана Бернара.

На каждой из них изображено одно из мест, связанных с биографией герцога Омальского : дворец Пале-Рояль, где он родился, лицей Генриха IV — место его учёбы, замок в Вилле-Котре, где он провел часть своего детства, замки д’Омаль и де Гиз, принадлежавшие его семье, резиденция Туикнем в Англии, где он жил во время изгнания, и, наконец, замок в Палермо, принадлежавший семье его жены.

Андреа д'Ассизи известен как гений, священный разговор

Матиас Стом, Сара приводит Агарь к Аврааму

Рогир ван дер Вейден - Диптих Жанны Французской

Джованни даль Понте, коронация Марии

Пьер Миньяр, портрет Мольера

Жан-Огюст-Доминик Энгр - Портрет мадам Дювоси

Портрет Бонапарта, первого консула, 1803 г.

Галереи Логис

Кабинет Клуэ

Charles IX

Шарль Савойский

Энн Монморанси

Зал Каролины

Салон Орлеанских

Зал Изабэллы

Игроки в кафе Ламблин в Пале-Рояль

Зал Джотто

Ротонда Минерва

Дюплесси - Луиза Мария Аделаида де Бурбон

Зал де ла Смалах

Шарль Жалабер, Анри Орлеанский, герцог Омаль

Продолжение следует