Родилась в семье с давними художественными традициями. Первые уроки живописи получила у отца художника Иоанна-Вильгельма Прейера (1803—1889). Родной брат и сестра отца Густав Прейер и Луиза Прейер также были живописцами.

Свой первый натюрморт Эмили написала в 1867 году. Эмили работала в той же скрупулезной технике, что и еë родной отец.

Так как женщины в то время не имели права получать высшее образование, неофициально посещала Дюссельдорфскую художественную школу. С целью совершенствования техники живописи Эмили Прейер совершила поездку по Европе, посетила музеи Дрездена, Антверпена и городов Голландии. 

Участница выставок в Берлине, Дрездене и Дюссельдорфе.