Можно подать в суд.
Как минмум - написать жалобу на имя директора школы и в РОНО, обязательно заказным письмом с уведомлением.

Законы, разрешающие отказ от вакцинации и реакции Манту тут:
http://www.liveinternet.ru/community/3084741/post107277785/

Ни одна медицинская манипуляция несовершеннолетнему не может быть проведена без разрешения родителей!

http://immunologia.ru/vaccin.html
Статья 11. Требования к проведению профилактических прививок
2. Профилактические прививки проводятся с согласия граждан, родителей или иных законных представителей несовершеннолетних и граждан, признанных недееспособными в порядке, установленном законодательством Российской Федерации.

Там есть ограничения, кажется, на время эпидемий. Но я не уверена, и сейчас не эпидемия. А вообще советую просто написать отказ от прививок и вручить врачу школы с уведомлением классного руководителя. Всегда так делала.

Ответ на комментарий Venda1 # Если объявлена эпидемия, то непривитый ребёнок просто не ходит в школу, пока эпидемия не будет снята. Но прививать без ведома родителей всё равно не имеют права. Родители решают: прививать или пока не посещать школу.

Ответ на комментарий Venda1 # отказ был написан. и в школе все об этом знают. У сына алергия на медикамента.

Тогда это - профессиональное преступление. Как здоровье сына? Надеюсь, он не очень пострадал?